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年终盘点| 2022年吉凯蛋白质组平台全年回顾

人阅读 发布时间:2023-01-06 16:55

岁末将至,感谢各位用户陪伴吉凯走过不平凡的2022年。回望过去的一年,吉凯蛋白质组学秉承让广大研究型医生的科研工作更省心、更省力、更高效的初心,致力于提供远超同行交付标准的服务质量和水准,同时助力多篇高水平研究发表,并获得了广大用户的赞赏和认可 。下面就跟随小编的脚步,一起来回顾吉凯蛋白质组学不断前进的科研印记吧。


三套新版生信报告发布,助力临床科研挖掘更轻松
Part. 1
全新定量蛋白质组学报告发布,打造行业高标准生信分析

新版报告采用的是全新的网页版设计,内含多重交互式体验,提供三套差异筛选标准的分析结果,包含蛋白质动态分布范围、PCA分析、GO/KEGG分析、GSEA分析、PPI分析以及转录因子等多达25项标准分析内容,同时报告中还提供《关键蛋白质候选列表》、后续研究思路及投稿期刊建议等内容,真正做到让临床科研工作者更省心、更省力、更高效。



Part. 2
蛋白质组+磷酸化蛋白质组联合报告发布,复刻高水平研究文章逻辑和生信分析  

近年来,蛋白质组+磷酸化蛋白质组联合表现出强劲的增长势头。基于对高水平研究的深刻理解和分析,吉凯对蛋白质组+磷酸化蛋白质组联合分析内容进行了全面升级,新版报告包含3大分析模块,对应从基础到复杂的生信数据分析内容,也符合高水平研究的数据呈现逻辑,同时还新增两组学相关性分析、激酶-底物和弦图以及激酶活性等14项分析,累计提供标准生信分析多达27项。同时为满足科研用户对激酶功能的深度科研需求,提供激酶树、激酶抑制剂&药物注释服务和定制病毒等三大高级服务。新版联合分析报告涉及高水平文献37篇,让整篇报告都有据可依。



Part. 3
全新生物标志物筛选算法,单变量和多变量ROC分析助力筛选最佳的生物标志物(或组合)

虽然早期蛋白质生物标志物筛选工作中,研究者倾向于获得一种特定的蛋白质作为生物标志物,但近年来诸多研究表明将多个标志物进行组合形成新的评判指标能有效提升预测准确性,显然将多种标志物定量结果组合形成综合性的评判指标或将成为今后研究的主流趋势。因此,吉凯基因率先对生物标志物算法进行升级,提供单变量和多变量联合分析内容,以帮助研究者筛选最佳的生物标志物(或组合)。



4D家族新品不断,致力于研发有助于数据质量提升的优质检测技术
Part. 1
4D蛋白质组硬核升级,timsTOF Pro2助力蛋白质组学鉴定更多、更准

基于timsTOF Pro2的发布,吉凯4D蛋白质组开启双平台服务模式!相比于timsTOF Pro,timsTOF Pro 2 配备了新一代双TIMS分析器,离子容量可提高三倍,最大限度地提高了离子传输效率和灵敏度,让蛋白质组学分析再上一个新的台阶,助力蛋白质组鉴定更准确、更多。

吉凯基因4D蛋白质组开启双平台模式

Part. 2
4D-DIA磷酸化重磅发布:大样本磷酸化的检测技术

基于timsTOF Pro/Pro2平台建立的4D磷酸化蛋白质组,为实现磷酸化定量蛋白组分析带来了更优秀的解决方案。200 µg hela细胞的90分钟测试数据表明,相比传统label free磷酸化检测技术,4D label free磷酸化检测能力提升60%,4D-DIA磷酸化检测能力甚至提高了1.2倍!此外,4D-DIA磷酸化蛋白质组学为全景式扫描,数据缺失值少,鉴定与定量结果的可重复性更高,三次技术重复性达85%,定量相关性在0.9以上,是当之无愧的大样本检测技术。
 

Part. 3
靶向蛋白质检测技术4D-PRM:无需依赖抗体,一次可检测多种蛋白

4D-PRM在普通的PRM的基础上,利用离子淌度新一维的分离,提高了离子的选择性和灵敏度,并结合了PASEF的扫描速度优势,从而增加了靶标离子的数量,可实现更多更快更准确的靶向蛋白组检测,带领靶向蛋白组学突破研究瓶颈进入新高度!

同免疫测定法比较,4D-PRM一次可检测多种蛋白,无需依赖抗体,其应用前景有望在将来取代传统的WB、ELISA等方法。除了常规蛋白组研究中差异目标蛋白的验证,4D-PRM也为靶向蛋白质组学技术在大队列生物标志物验证和临床转化应用方面带来更多可能。


Part. 4
超灵敏Olink蛋白质新品:与质谱互补技术,助力临床血液蛋白质标志物筛选

人体蛋白质种类众多,存在着来源广、组成复杂等特点。然而目前基于质谱检测的蛋白质组学技术更倾向于高丰度物质的检测,容易丢失了很多低丰度蛋白与疾病关系的重要信息。新一代的Olink蛋白质组学平台应运而生,弥补了质谱在血液样本检测中的缺陷,为血液蛋白质标志物的发展提供了新的检测方向。Olink平台基于邻位延伸分析技术(PEA),既覆盖了广泛的动态范围,横跨10个log,覆盖了高、中、低丰度蛋白;又有基因组学的高通量,保留了蛋白/抗原识别的特异性,检测蛋白丰度最低可以达到fg/ml,可对疾病早筛相关的蛋白生物标志物进行多重、灵敏、高通量的检测。



 助力众多高水平研究成果,客户投稿文章深度解读合作成果 

吉凯基因不仅提供优质的检测技术,同时也秉承“客户至上”的服务理念,提供优质的售前售后服务,协助解读报告,返修数据,整理论文思路以及上传原始数据和回复编审问题,是广大用户最忠诚的合作伙伴。过去一年,吉凯蛋白质组客户发表了诸多高水平研究,我们也有幸收到多篇客户投稿的文章,深度解读了吉凯助力的科研成果!

1.Nat Commun | 吉凯助力南京鼓楼医院/南京大学生命科学学院合作发现肿瘤特异性肺转移的新机制
2.吉凯助力!中山大学肿瘤防治中心陈明教授团队揭示PI3K/AKT通路激活可能是小细胞肺癌放化疗耐药的潜在机制
3.Autophagy | 复旦大学邵春林教授团队新发现:TGM2在协调自噬溶酶体融合以及胶质母细胞瘤辐射抵抗中发挥重要功能
4.吉凯助力!IF10| 山东省立医院研究团队揭示miRNA在阿尔兹海默病中的功能和作用机制
5.Nature旗下CDD| 武汉大学人民医院首次发现CLDN4蛋白在恶性胶质瘤中的调控机制
6.CDD| 中山医院程蕾蕾/赵健元教授团队发现E3泛素化连接酶(TRIM25)能够有效缓解阿霉素诱导的心脏毒性
7.吉凯助力!中南大学湘雅医学院附属海口医院黄晓曦教授团队新发现:细胞周期蛋白CCNB2在肝细胞癌发生发展机制中发挥重要作用
8.IF10!吉凯助力福建医科大学附属第一医院研究团队揭示HBV感染自然进程中的蛋白特征及潜在生物标志物

2022年吉凯基因始终秉承让广大研究型医生的科研工作更省心、更省力、更高效的初心,致力于提供远超同行交付标准的服务质量和水准。新的一年,吉凯蛋白质组学平台仍将聚焦前沿检测技术与新的学术成果,以更好产品和更好服务回馈广大用户的喜爱与支持,为广大用户提供更优质的检测技术与各类TOP期刊生信分析,敬请期待!


吉凯基因凭借多年在靶标筛选及验证服务领域的技术积累,建立的标准化 、工程化 、系统化的GRP平台,为中国研究型医生提供科研服务,加快科研成果转化。其中,多组学平台包含蛋白质组学平台和高通量测序平台

·蛋白质组学平台拥有多台timsTOF ProExploris 480高精度质谱仪,专业的Spectronaut PlusarMascot等分析软件,提供专业的4DDIATMTPRM、磷酸化修饰组、olink蛋白质组等检测服务,强大的机器学习算法、IPA分析、蛋白基因组分析服务,系统的生物标志物、分子分型、药物靶点、基因功能研究等解决方案,真正让广大研究型医生的科研工作更省心、更省力、更高效;

·高通量测序平台分为常规测序服务和单细胞测序服务:单细胞测序拥有10x和BD两个平台,提供单细胞RNA-seq、单细胞核测序、单细胞混样RNA-seq、单细胞TCR/BCR、单细胞(RNA+ATAC)、空间转录组测序等服务;常规测序服务提供meRIP-seq(m6A/m1A/m7G/m5C 等RNA甲基化修饰测序)、acRIP-seq(ac4C RNA乙酰化修饰测序)、ATAC-seq、Ribo-seq(翻译组测序) 、mRNA/miRNA/LncRNA/circRNA-seq、全转录组测序(两文库/三文库)、外泌体miRNA/LncRNA-seq、WGS/WES、WGBS、RRBS、BSAS等服务。


 

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