单细胞测序发文没思路？吉凯基因帮你轻松搞定数据挖掘！

我的数据到底该怎么分析？

如何从成千上万个细胞中找到有生物学意义的细胞群？

单细胞文章套路是什么？怎样才能讲好一个完整的故事？

单细胞文章的两大经典套路

在单细胞测序领域，文章思路主要分为两大类：

（Cell Atlas）

目标：全面解析样本中的细胞组成，绘制细胞图谱（如肿瘤微环境、器官发育等）。

关键分析：

• 细胞聚类与注释（主群+亚群）

• 细胞类型比例比较（正常 vs 疾病）

• 稀有细胞亚群鉴定

（Focused Analysis）

目标：聚焦特定细胞群的生物学变化（如某类免疫细胞在疾病中的作用）。

关键分析：

• 筛选占比显著变化或差异基因最多的细胞群

• 亚群细分与功能富集

• 拟时序分析、细胞互作、转录调控等深入挖掘

无论你的研究方向是构建图谱还是聚焦特定细胞群，吉凯的《单细胞文章思路报告》都能为你提供清晰的分析框架！

吉凯「单细胞文章思路报告」

四大模块解析

为了帮助老师们高效利用单细胞数据，我们将整套分析流程拆解为4份逻辑连贯的报告，逐步引导你锁定关键细胞群，构建完整故事线。

目标：明确样本中的主要细胞类型，筛选潜在目标群。

核心分析：

• 细胞聚类（t-SNE/UMAP降维可视化）

• 主群细胞类型注释（基于经典标记基因，如CD3E→T细胞）

• 细胞组成差异分析（比较不同组间细胞比例变化）

输出价值：
✅ 快速了解样本整体细胞组成
✅ 初步筛选占比差异显著的细胞群（为亚群细分提供科学依据）

目标：深入分析各细胞群的基因表达变化及细胞间通讯。

核心分析：

• 组间差异基因分析（如肿瘤 vs 正常）

• 通路富集（GO/KEGG）揭示功能变化

• 细胞互作网络（CellChat分析配体-受体对）

输出价值：
✅ 锁定差异最显著的细胞群（如高表达炎症基因的巨噬细胞）
✅ 提供亚群细分的科学依据（如“这群细胞差异基因多，值得深挖！”）

目标：对关键细胞群进一步细分，发现新的生物学特征。

核心分析：

• 关键细胞群再分亚群

• 亚群注释

• 亚群组成与差异

输出价值：
✅ 揭示细胞异质性（如CD8+ T细胞可细分为效应T细胞、耗竭T细胞等）
✅ 为后续机制研究提供精准靶点

目标：围绕目标亚群构建完整故事线。

核心分析：

• 拟时序分析（Monocle3）→ 细胞分化轨迹

• 转录因子调控网络（SCENIC分析）

• 细胞通讯分析（CellChat）

输出价值：
✅ 形成“细胞表型→功能→调控机制”的完整逻辑链
✅ 满足10分+文章的数据深度要求

如何选择目标细胞群？

——吉凯的三大筛选策略

很多老师困惑：“我该选哪个细胞群深入分析？”

我们的报告提供3种科学筛选策略：

例如：肿瘤组中CD8+ T细胞比例显著升高→可能具有抗肿瘤功能。

例如：某群巨噬细胞组间差异基因达500个→调控活跃。

若暂无明确目标，优先分析大群体（小群体可能因样本量不足导致无统计学意义）。

吉凯基因：从数据挖掘到药物研发的全链条服务

除了单细胞测序分析，吉凯基因还提供多组学数据整合分析（空间转录组、转录组、蛋白组、代谢组等），并支持小分子、抗体、ADC药物的早期研发，真正实现从基础研究到临床转化的闭环。