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分裂内含肽火了!突破 AAV 容量,助力大蛋白体内递送与基因编辑!

14 人阅读发布时间:2025-12-05 14:18

在基因治疗和生命科学研究中,大型功能蛋白的应用越来越广泛,但其编码基因长度常常超出AAV载体约4.7 kb的包装极限,严重制约了发展。分裂内含肽技术的出现,成功打破这一壁垒,为实现大蛋白的高效递送提供了全新路径。

 

什么是分裂内含肽?

分裂内含肽(Split intein)是一种能够高效连接蛋白片段且连接后无痕的天然蛋白质序列,在基因编辑和合成生物学中展现出巨大潜力。通过将一个大蛋白拆分为两个部分,并在细胞内重新组装为完整功能蛋白,分裂内含肽系统成功解决了腺相关病毒载体容量有限的问题,为体内递送大基因及大型基因编辑工具如 Prime Editor 提供了可行方法。

 

分裂内含肽的设计原理

 

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分裂内含肽可以自我切除并连接两侧外显肽(extein),它能够通过自催化机制实现蛋白质片段的精准拼接,这一过程不需要额外的辅因子或酶参与,具有高度特异性。

 

在Npu DnaE分裂内含肽系统中,NpuC和NpuN来自Nostoc punctiforme的DnaE:

NpuN:包含内含肽的N端部分,具有自剪接活性

NpuC:包含内含肽的C端部分,与NpuN协同完成剪接反应

 

设计时将目标蛋白在柔性区域切割为两段,分别与 NpuN 和 NpuC 融合表达。当这两个部分在细胞内共表达时,内含肽介导的剪接反应,将两侧的“外显肽”无缝连接成一个完整的功能蛋白。

 

 

分裂内含肽在引导编辑中的应用

 

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腺相关病毒(AAV)包装容量限制在~4.7kb以内,而引导编辑工具 Prime Editor蛋白长度超过 6 kb,单个AAV无法包装下;分裂内含肽系统通过合理设计,很好的突破AAV载体的容量限制问题:

 

  • 构建双 AAV 系统:将编辑蛋白分为 N 端和 C 端两部分,包装成两个 AAV 病毒;

 

  • 内含肽介导的细胞内重组:两个 AAV 病毒共感染细胞,NpuN 与 NpuC 触发剪接,形成具有完整编辑活性的蛋白;

 

  • 编辑效率验证:结合分裂内含肽的引导编辑系统v3em PE-AAV系统实现了高达 42%~46% 的编辑效率,是目前较高效的 AAV 介导体内编辑系统之一。

 

此外,该系统也适用于其它大蛋白,如杜氏肌营养不良症(DMD基因)、Cas9 核酸酶等。

 

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嘌呤霉素蛋白不同分裂位点效率验证

 

注意事项

 

1:分裂位点选择:应优先选择柔性区域或非保守区,避免破坏蛋白整体折叠与功能(侧翼残基和局部蛋白质折叠会影响内含肽介导的反式剪接的效率)。

 

2: C 端外显肽起始氨基酸:C端外显肽的前几位氨基酸是维持剪接反应的关键活性位点,会显著影响剪接效率;设计时需根据不同内含肽的特点选择适合的目的蛋白分裂位点。

 

3 :分裂位点评估:选多个候选位点,验证不同位点的分裂蛋白在细胞内的重组效率,选择效率高的位点继续下一步实验。

 

参考文献:

1 分裂内含肽: 一种高效的无痕多肽片段连接工具

2 Efficient prime editing in mouse brain, liver and heart with dual AAVs

3 Split selectable markers

4 Intein-mediated protein trans-splicing expands adeno-associated virus transfer capacity in the retina

5 Split intein-mediated protein trans-splicing to express large dystrophins

6 Dual-AAV delivering split prime editor system for in vivo genome editing

声明:吉凯基因团队专注介绍生命科学领域前沿研究方法。本文仅作为信息交流的目的,文中观点不代表吉凯基因支持文中观点或者方案推荐。如需获得实验方案指导,请自行查阅文献。

 

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