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14 人阅读发布时间:2025-12-05 14:18
在基因治疗和生命科学研究中,大型功能蛋白的应用越来越广泛,但其编码基因长度常常超出AAV载体约4.7 kb的包装极限,严重制约了发展。分裂内含肽技术的出现,成功打破这一壁垒,为实现大蛋白的高效递送提供了全新路径。
什么是分裂内含肽?
分裂内含肽(Split intein)是一种能够高效连接蛋白片段且连接后无痕的天然蛋白质序列,在基因编辑和合成生物学中展现出巨大潜力。通过将一个大蛋白拆分为两个部分,并在细胞内重新组装为完整功能蛋白,分裂内含肽系统成功解决了腺相关病毒载体容量有限的问题,为体内递送大基因及大型基因编辑工具如 Prime Editor 提供了可行方法。
分裂内含肽的设计原理

分裂内含肽可以自我切除并连接两侧外显肽(extein),它能够通过自催化机制实现蛋白质片段的精准拼接,这一过程不需要额外的辅因子或酶参与,具有高度特异性。
在Npu DnaE分裂内含肽系统中,NpuC和NpuN来自Nostoc punctiforme的DnaE:
NpuN:包含内含肽的N端部分,具有自剪接活性
NpuC:包含内含肽的C端部分,与NpuN协同完成剪接反应
设计时将目标蛋白在柔性区域切割为两段,分别与 NpuN 和 NpuC 融合表达。当这两个部分在细胞内共表达时,内含肽介导的剪接反应,将两侧的“外显肽”无缝连接成一个完整的功能蛋白。
分裂内含肽在引导编辑中的应用


腺相关病毒(AAV)包装容量限制在~4.7kb以内,而引导编辑工具 Prime Editor蛋白长度超过 6 kb,单个AAV无法包装下;分裂内含肽系统通过合理设计,很好的突破AAV载体的容量限制问题:
构建双 AAV 系统:将编辑蛋白分为 N 端和 C 端两部分,包装成两个 AAV 病毒;
内含肽介导的细胞内重组:两个 AAV 病毒共感染细胞,NpuN 与 NpuC 触发剪接,形成具有完整编辑活性的蛋白;
编辑效率验证:结合分裂内含肽的引导编辑系统v3em PE-AAV系统实现了高达 42%~46% 的编辑效率,是目前较高效的 AAV 介导体内编辑系统之一。
此外,该系统也适用于其它大蛋白,如杜氏肌营养不良症(DMD基因)、Cas9 核酸酶等。

嘌呤霉素蛋白不同分裂位点效率验证
注意事项
1:分裂位点选择:应优先选择柔性区域或非保守区,避免破坏蛋白整体折叠与功能(侧翼残基和局部蛋白质折叠会影响内含肽介导的反式剪接的效率)。
2: C 端外显肽起始氨基酸:C端外显肽的前几位氨基酸是维持剪接反应的关键活性位点,会显著影响剪接效率;设计时需根据不同内含肽的特点选择适合的目的蛋白分裂位点。
3 :分裂位点评估:选多个候选位点,验证不同位点的分裂蛋白在细胞内的重组效率,选择效率高的位点继续下一步实验。
参考文献:
1 分裂内含肽: 一种高效的无痕多肽片段连接工具
2 Efficient prime editing in mouse brain, liver and heart with dual AAVs
3 Split selectable markers
4 Intein-mediated protein trans-splicing expands adeno-associated virus transfer capacity in the retina
5 Split intein-mediated protein trans-splicing to express large dystrophins
6 Dual-AAV delivering split prime editor system for in vivo genome editing
声明:吉凯基因团队专注介绍生命科学领域前沿研究方法。本文仅作为信息交流的目的,文中观点不代表吉凯基因支持文中观点或者方案推荐。如需获得实验方案指导,请自行查阅文献。
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